Bebeklerde amipli dizanteri; tüketilen besinlerden bulaşan amip tek hücreli bir canlıdır. Bebeklere bulaşmasındaki en etkili yol ise temas ettikleri cisimler üzerinde bu canlının bulunmasıdır. Amip insan vücuduna ağız yoluyla girer ve bağırsaklara tutunur. Bağırsaklara tutunmasına yardımcı yalancı ayaklara sahiptir. Amipler bölünerek ürer ve insan vücudunda kendisine uygun ortamı bulduktan sonra çok hızlı çoğalma gösterirler. Amipli dizanterinin oluşmasındaki ilk aşama ise kalın bağırsaklara tutunup burada ülser adı verilen küçük yaralara yol açmasıdır. Bunun sonrasında görülen kanlı ishal amipli dizanteri hastalığının diğer adı da denilebilir. Bu yaraların büyüyüp genişlemesi ile oluşan amipli dizanteri şiddetli karın ağrılarına neden olmaktadır. Eğer bebeğin dışkısında kan, kötü koku ve ishal görülüyorsa amipli dizanteri hastalığı düşünülmelidir. Amipli dizanteri hastalığı amipin uzun bir kuluçka dönemi geçirmesinden sonra çok hızlı etki gösterir. Bebeklerde amipli dizanteri çok fazlakanlı ishale sebep olur ve aynı zamanda ateş yükselmesi de bu hastalığın bebeklerdeki en büyük etkileridir.